يتبع مكتب الفاعلية المؤسسية مباشرة لمدير الجامعة، ويقوم المكتب بشكل أساسي بمهمة الإشراف على ضمان الجودة الأكاديمية في جامعة الإمارات العربية المتحدة، ويتألف المكتب من قسمين، يعملان معًا لتعزيز رسالة الجامعة:
ويشرف قسم ضمان الجودة الأكاديمية على مراجعة واعتماد البرامج الأكاديمية وتقييم مخرجات التعلم، ويوفر قسم البحوث المؤسسية مجموعة متنوعة من خدمات جمع البيانات والتحليل وإعداد التقارير التي تهدف إلى تقييم مهام الجامعة الإدارية والخدمية، ودعم تقييم الجودة الأكاديمية.
